Мультиплексная хМАР-технология детекции генетических мутаций меланоцитом

Елена Ивановна Антонова, Наталья Викторовна Фирсова, Атабег Батырович Ачилов, Айдар Раилевич Зимнуров, Иван Алексеевич Лукьянов, Елена Валерьевна Балацюк, Наталья Анатольевна Ленгесова, Павел Сергеевич Торутанов, Elena Antonova, Natalia Firsova, Atabeg Achilov, Aidar Zimnurov, Ivan Lukyanov, Elena Balacuk, Natalia Lengesova, Pavel Torutanov

Аннотация


В рамках разработки отечественной диагностической тест-системы с использованием технологии xMAP-ASPE-xTAG с целью ранней диагностики и выявления предрасположенности к развитию меланомы по разработанному авторами протоколу детекции мутаций анализируемых генов в образцах узловой меланомы (NM) и диспластического невуса с пигментным компонентом (DMN) отработаны этапы определения в одном аналите нескольких мутаций, сопряженных с онкогенезом меланомы – BRAF (rs113488022; p.V600E; c.1799T>A), MITF-М (rs149617956; p.E318K; c.952G>A), CDKN2А (rs121913386, p.P114L, c.341C>T; rs121913387, p.R58*, c.172C>T; rs121913388, p.R80*, c.238C>T; rs121913389, p.W110*, c.330G>A; rs1057519852, p.W110*, c.329G>A). У трех пациентов из четырех с локализацией DMN в области тела non-CSD выявлено наличие мутантного варианта гена BRAF. У одного пациента из этой группы определены мутации в трех генах – BRAF, MITF-М, CDKN2А. У одной пациентки не выявлено наличия мутантных вариантов анализируемых генов, в сочетании с гистологическими характеристиками данное образование можно отнести к банальному меланоморфному невусу (доброкачественная меланоцитома). По результатам генетического скрининга выявлены два вида меланом относительно драйверной мутации гена BRAF: 1-я группа – меланомы BRAF-негативные (wtBRAF); 2-я группа – меланомы BRAF-позитивные (mtBRAF). У всех трех пациентов с узловой меланомой с пигментным компонентом (NM) wtBRAF образования локализованы в соответствии с кумулятивным солнечным повреждением lowCSD, выявлена мутация гена CDKN2A и дополнительно у двух пациентов – мутация гена MITF-М. В группе mtBRAF меланом (пять пациентов) выявлены меланомы как mtBRAF NM с пигментным компонентом, так и mtBRAF амеланотического варианта NM (ANМ). В частности, mtBRAF NM обнаружена у трех пациентов, и у одного из этой группы дополнительно выявлена мутация MITF-М. Также к данной группе отнесли двух пациентов mtBRAF ANM, при этом у пациента женского пола дополнительно выявлена мутация CDKN2A. Все образования данной группы с локализацией в соответствии с кумулятивным солнечным повреждением как lowCSD, так и highCSD. Оптимизация условий проведения исследований позволила достичь приемлемой чувствительности и надежной производительности детекции анализируемых мутаций генов.

Ключевые слова


xMAP-технология; микросферы; мультиплексная диагностика генетических мутаций; узловая меланома с пигментным компонентом; узловая меланома беспигментная(амеланотическая); ген BRAF; ген MITF-М; ген CDKN2А; ранняя диагностика меланомы; диспластический невус

Полный текст:

PDF

Литература


Антонова Е. И., Ачилов А. Б., Фирсова Н. В., Викторов Д. А., Балацюк Е. В. Разработка xMAP-протокола ASPE детекции мутаций генов BRAF и MITF в образцах поверхностно-распространяющейся меланомы кожи // Научный медицинский вестник Югры. 2024. Т. 42, № 4. С. 53–62. doi: 10.25017/2306-1367-2024-42-53-62

Снарская Е. С., Олисова О. Ю., Васильева К. Д. Амеланоцитарная узловая меланома кожи у пациентки с отягощенным семейным анамнезом // Российский журнал кожных и венерических бо- лезней. 2022. Т. 25, № 4. C. 261–268. doi: 10.17816/dv111571

Aebischer V., Abu-Ghazaleh A., Metzler G., Riedl L., Garbe C., Flatz L., Eigentler T., Forchhammer S. Histopathologic abundance of pigmentation correlates with disease-specific survival in malignant melanoma but is not independent of current AJCC pT stage // Pigment Cell Melanoma Res. 2023. Vol. 36, no. 6. P. 512–521. doi: 10.1111/pcmr.13114

Colombino M., Casula M., Paliogiannis P., Manca A., Sini M. C., Pisano M., Santeufemia D. A., Cossu A., Palmieri G. Heterogeneous pathogenesis of melanoma: BRAF mutations and beyond // Crit. Rev. Oncol. Hematol. 2024. Vol. 201. P. 104435. doi: 10.1016/j.critrevonc. 2024.104435

Drexler K., Zenderowski V., Schreieder L., Koschitzki K., Karrer S., Berneburg M., Haferkamp S., Niebel D. Subtypes of melanomas associated with different degrees of actinic elastosis in conventional histology, irrespective of age and body site, suggesting chronic ultraviolet light exposure as driver for lentigo maligna melanoma and nodular melanoma // Cancers (Basel). 2023. Vol. 16, no. 1. Art. 1. doi: 10.3390/ cancers16010001

Druskovich C., Kelley J., Aubrey J., Palladino L., Wright G. P. A review ofmelanoma subtypes: genetic and treatment considerations // J. Surg. Oncol. 2025. Vol. 131, no. 3. P. 356–364. doi: 10.1002/jso.27953 Frischhut N., Zelger B., Andre F., Zelger B. G. The spectrum of melanocytic nevi and their clinical implications // J. Dtsch. Dermatol. Ges. 2022. Vol. 20, no. 4. Р. 483–504. doi: 10.1111/ddg.14776

Gronbeck C., Kerr P. E. Nodular melanoma // Clin. Dermatol. 2025. Vol. 43, no. 1. P. 64–70. doi: 10.1016/ j.clindermatol.2025.01.015

Guźniczak A., Sosnowska-Sienkiewicz P., Szydłowski J., Kurzawa P., Januszkiewicz-Lewandowska D. Gene mutation-negative malignant melanoma in a prepubertal patient: a clinical and molecular case report // Genes. 2025. Vol. 16, no. 8. Art. 937. doi: 10.3390/ genes16080937

Huang C., Lau T. W.-S., Smoller B. R. Diagnosing cutaneous melanocytic tumors in the molecular era: updates and review of literature // Dermatopathology (Basel). 2024. Vol. 11, no. 1. P. 26–51. doi: 10.3390/ dermatopathology11010005

Jiang C., Jain N. P., Stewart C. L. Amelanotic melanoma: clinical presentation, diagnosis, and management // Clin. Dermatol. 2025. Vol. 43, no. 1. P. 10–15. doi: 10.1016/j.clindermatol.2025.01.009

Manganelli M., Stabile G., Scharf C., Brunetti A. P., Paolino G., Giuffrida R., Bigotto G. D., Damiano G., Mercuri S. R., Sallustio F., Mangano E., Bordoni R., De Nardi P., Guida G., Foti C., Argenziano G., Longo C., Pellacani G., Rizzo N., Russo V., Guida S., Rongioletti F. Skin photodamage and melanomagenesis: A comprehensive review // Cancers. 2025. Vol. 17, no. 11. Art. 1784. doi: 10.3390/cancers17111784

Mirek J., Bal W., Olbryt M. Melanoma genomics – will we go beyond BRAF in clinics? // J. Cancer Res. Clin. Oncol. 2024. Vol. 150, no. 9. Art. 433. doi: 10.1007/s00432-024-05957-2

Paller C. J., Tukachinsky H., Maertens A., Decker B., Sampson J. R., Cheadle J. P., Antonarakis E. S. Pancancer interrogation of MUTYH variants reveals biallelic inactivation and defective base excision repair across a spectrum of solid tumors // JCO Precis. Oncol. 2024. Vol. 8, no. 8. e2300251. doi: 10.1200/PO.23.00251

Prkăcin I., Šamija I., Filipović N., Vucić M., Vučić M., Ferara N., Šitum M. Frequency of BRAF mutations in dysplastic nevi, lentigo maligna, and melanoma In Situ // J. Clin. Med. 2024. Vol. 13, no. 16. Art. 4799. doi: 10.3390/ jcm13164799

Singh N., Dunlop K. L. A., Woolley N., Wills Vashishtha T., Damian D. L., Vuong K., Cust A. E., Smit A. K. A review of skin cancer primary prevention activities in primary care settings // Public Health Res. Pract. 2024. Vol. 34(2). Art. 34012401. doi: 10.17061/phrp34012401

Spaccarelli N., Drozdowski R., Peters M. S., Grant-Kels J. M. Dysplastic nevus part II: Molecular/genetic profiles and management // J. Am. Acad. Dermatol. 2023. Vol. 88, no. 1. P. 13–20. doi: 10.1016/j.jaad.2022.05.071

Sukniam K., Manaise H. K., Popp K., Popp R., Gabriel E. Role of surgery in metastatic melanoma and review of melanoma molecular characteristics // Cells. 2024. Vol. 13, no. 6. Art. 465. doi: 10.3390/cells13060465

Wallingford C. K., Maas E. J., Howard A., DeBortoli E., Bhanja D., Lee K., Mothershaw A., Jagirdar K., Willett R., Betz-Stablein B., Sturm R. A., Soyer H. P., McInerney-Leo A. M. MITF E318K: A rare homozygous case with multiple primary melanoma // Pigment. Cell Melanoma Res. 2024. Vol. 37, no. 1. P. 68–73. doi:10.1111/pcmr.13122

Zhang S., Xiao X., Yi Y., Wang X., Zhu L., Shen Y., Lin D., Wu C. Tumor initiation and early tumorigenesis: molecular mechanisms and interventional targets // Signal Transduct. Target. Ther. 2024. Vol. 1. Art. 149. doi:10.1038/s41392-024-01848-7




DOI: http://dx.doi.org/10.17076/eb2257

Ссылки

  • На текущий момент ссылки отсутствуют.


© Труды КарНЦ РАН, 2014-2019